宏基因组bining+宏转录组强强联合

ciluanlan

　　硫循环微生物影响湿地的有机质分解，进而影响全球相关环境的温室气体排放。然而，这些微生物的种属和生理特性在很大程度上是未知的。

　　通过功能宏基因组学的方法，研究者从酸性泥炭地中恢复了7株新的酸杆菌基因组草图，这些酸杆菌都具有潜在的异化亚硫酸盐（dsrAB,dsrC,dsrD,dsrN,dsrT,dsrMKJOP）或硫酸盐呼吸（sat,aprBA,qmoABC和dsr）相关功能基因。令人惊讶的是，这些基因组也编码了DsrL蛋白，迄今为止该基因只在硫氧化微生物中发现。

　　通过[url=http:///www.illumina.com.cn/areas-of-interest/microbiology/microbial-sequencing-methods/microbial-transcriptomics.html]宏转录组[/url]分析进一步展示了酸杆菌的硫代谢基因在原生泥炭土壤中的表达情况以及它们在不同缺氧环境下的上调表达情况。这一结果说明了硫酸盐呼吸途径具有表达活性，但是，也有可能是像硫氧化细菌Desulfurivibrioalkaliphilus那样进行异化硫氧化或分歧反应。酸杆菌中仅存在亚硫酸盐还原功能基因，同时还编码一些可以将亚硫酸盐从有机磺酸盐中释放出来的酶，这表明它们可以利用有机硫化合物作为一种补充能源。

　　此外，研究者还对它们的代谢潜力进行了进一步研究，包括多糖水解、糖利用、有氧呼吸、发酵能力和氢氧化等。这些研究的结果既扩展了已知酸杆菌的生理和遗传特性，以及基于dsrAB基因的硫代谢微生物的分类学多样性，也强调了这些兼性厌氧酸杆菌在湿地环境中的一种新的基础生态位，即利用无机和有机硫分子来提供能量。